اركان مركز آموزش لاپاروسكوپی دانشگاه علوم پزشكی تهران عبارتند از:

الف- شورای عالی مركز

ب- رئيس مركز

ج- شورای آموزشی و پژوهشی مركز

اعضا شورای عالی مركز عبارتند از:

1.       رئيس دانشگاه علوم پزشكی و خدمات بهداشتی درمانی تهران.

2.       معاون آموزشی دانشگاه.

3.       معاون پژوهشی دانشگاه.

4.       رئيس مركز كه دبيری شورای عالی را به عهده دارد.

5.       سه نفر اعضای هيأت علمی از گروه‌های جراحی عمومی، جراحی زنان و زايمان و اورولوژی با سابقه كار در زمينه جراحی‌های درون‌بين (آندوسكوپی و لاپاروسكوپی).

وظايف شورای عالی مركز به شرح زير می‌باشد:

1.       سياستگذاری و تصويب خط مشی‌های آموزش و پژوهشی و تدوين نحوه تعاملات و تامين منابع (مالی، انسانی، فنی و تجهيزاتی) مركز.

2.       تصويب دستورالعمل‌های مربوط به امور شورای عالی و موارد اجرايی مركز.

3.       پيشنهاد سازمان و تشكيلات مركز

4.       بررسی و تصويب بودجه ساليانه مركز در محدوده اعتبارات تخصيصی و با رعايت ضوابط قانونی.

5.       بررسی و تصويب دوره‌های آموزشی و طرحهای تحقيقاتی مركز.

6.       بررسی و تصويب طرحها و پروژه‌های همكاری با ساير مراكز آموزش، دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزشی - پژوهشی و انجمنهای علمی داخل و خارج كشور و سازمانهای بين‌المللی مطابق مقررات و ضوابط مربوطه.

7.       بررسی و تصويب گزارش ساليانه فعاليتهای مركز.